في الحقيقة تتطلع جامعة الشرق الأوسط الالكترونية بدعم من الهيئة العالمية للتعليم الالكتروني وبعض الهيئات والمنظمات المهمتة في مجال التعليم الالكتروني والتعليم عامةً ، إلى تخفيض التكاليف إلى الحد الأدنى منها ، ويوجد حالياً دعم خاص من الهيئة العالمية للتعليم الالكتروني حيث أن الوحدات التعليمية مدعومة بالكامل ( مجانية) وذلك لفترة مؤقته تشجيعية على خوض تجربة التعليم الالكتروني .. ولكن يترتب على الدارس دفع رسوم التسجيل والرسوم الادارية والاختبارات الالكترونية ورسوم ارسال الشهادة. كما يمكن مراسلة ادارة التسجيل والقبول على الايميل : [email protected] لطلب تخفيض على الرسوم الادارية ورسوم التسجيل في حال عدم القدرة على تحمل التكاليف .